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Analisa as diferenças e semelhanças nos critérios estabelecidos para qualificação de periódicos científicos brasileiros pela Agência Capes/MEC e busca nas contribuições de Merton e Bourdieu, elementos para a compreensão desse fenômeno. Os dados foram levantados por meio dos 48 Documentos de Área disponíveis no sistema Qualis/Capes. A análise permitiu levantar 21 critérios e agrupá-los em quatro categorias: formato e aspectos de editoração e distribuição; visibilidade e impacto dos conteúdos; qualidade e relevância segundo percepção da área; e outros. As diferenças e semelhanças nos critérios e as particularidades das áreas estudadas quanto à avaliação de periódicos colocaram em relevo a relevância e atualidade do pensamento de Merton e Bourdieu acerca das nuances que perpassam estratégias de legitimação especialmente caras na ciência. Conclui-se ressaltando a proeminência de indicadores quantitativos nas áreas mais tradicionais da ciência e mais subjetivos nas humanidades, como também, a natureza política do processo de avaliação da produção científica brasileira, no qual, as agências de fomento têm grande influência.