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A organização do conhecimento, tradicionalmente considerada no Brasil como tema ou especialidade da Ciência da Informação, vem gradativamente ganhando contornos de espaço investigativo autônomo, especialmente no âmbito do Capítulo Brasileiro da International Society for Knowledge Organization (ISKO-Brasil). A relação entre a organização do conhecimento e a Ciência da Informação é, todavia, assunto que revela diferentes perspectivas na literatura internacional e nacional. É possível observar uma tradição que insere a organização do conhecimento como parte integrante da Ciência da Informação, ao mesmo tempo em que despontam abordagens que preferem entender a organização do conhecimento e a Ciência da Informação como áreas separadas. É justamente a relação entre a organização do conhecimento e a Ciência da Informação que o presente estudo se propôs a investigar. Nesse sentido o objetivo da pesquisa é investigar como a comunidade científica brasileira vem concebendo a organização do conhecimento e sua relação com a Ciência da Informação. O escopo da investigação está delimitado pelos trabalhos publicados nos Anais da ISKO-Brasil. A análise, a interpretação e o tratamento dos resultados estão respaldados metodologicamente pelas técnicas da Análise de Conteúdo, definidas por Laurence Bardin. Os resultados alcançados mostram que, para a comunidade investigada, embora a organização do conhecimento já desenhe sua autonomia territorial com relação à Ciência da Informação, a mesma ainda guarda fundamental relação epistemológica com a esta última. Tal pesquisa pode contribuir para o aprofundamento do debate sobre a organização do conhecimento no Brasil e, principalmente, para a compreensão de como a comunidade científica do país a coloca em relação à Ciência da Informação.