Este estudo propõe uma modelização de temas presentes nos resultados de pesquisas da Embrapa Pantanal, constantes da literatura publicada, por meio de mapas conceituais. Busca apresentar conceitualmente e quantificar o universo formado a partir do mapeamento dos temas constantes nas publicações técnicas produzidas e editadas pela instituição, no período de 2007 a 2012. Fundamenta-se em aportes teóricos sobre modelização de domínios do conhecimento, teoria da classificação facetada, teoria do conceito, estudos cientométricos e mapas conceituais. Os procedimentos metodológicos compreendem as fases: levantamento de fontes, coleta e organização do universo empírico; análise descritiva referente a temas; modelização segundo a proposta categorial de Ranganathan; modelização por facetas e inserção das entidades/temas em mapas conceituais. Na estrutura semântica gerada pelo estudo, representada por mapas conceituais, constam classes com suas respectivas facetas e subfacetas do domínio. Dentre as classes relevantes foram destacadas da pesquisa para esta apresentação: Animais, Ecorregiões e Plantas, representando a diversidade de objetos de pesquisa da Embrapa no Pantanal. Os mapas conceituais produzidos podem contribuir para a política de pesquisa, permitindo a visualização de esforços empreendidos, pertinentes aos objetivos da instituição em relação à comunidade beneficiada.