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Os repositórios institucionais de acesso aberto maximizam as ações voltadas para a preservação e promoção do livre acesso à informação científica, apesar dos inúmeros desafios de caráter político, tecnológico, de recursos humanos e gestão que tangem à sua implementação, nota-se um crescimento do número de repositórios no país, contudo esses apresentam um baixo número de itens em suas coleções, o que pode estar relacionado com a ineficácia dos métodos de povoamento adotados. O objetivo deste estudo foi comparar a eficácia dos métodos de povoamento automatizados, envolvendo a extração de metadados da base de dados proprietária Web of Science e da Plataforma Lattes. O método utilizado foi o estudo de caso exploratório e a unidade caso foi a Universidade Federal de São Carlos (UFSCar). Como resultados, foram observadas diferenças significativas, nos resultados da aplicação dos dois métodos, quanto a completude e cobertura da produção científica recuperada, que se acentuaram quando analisadas por áreas do conhecimento. Conclui-se com base nos resultados que os métodos de povoamento a partir da Plataforma Lattes compreendem uma melhor solução quanto a completude e cobertura da produção científica.