Na área de Organização e Representação do Conhecimento da Ciência da Informação, o Tratamento Temático da Informação desempenha um papel fundamental no que tange à produção, tratamento e recuperação da informação na sociedade, como elo complementar entre a produção e o uso de informações. O trabalho teve como objetivo investigar a atuação bibliotecária em sistemas de recuperação de bibliotecas universitárias, por meio da indexação em base de dados e da catalogação de assunto em catálogo coletivo online, utilizando-se a metodologia da Avaliação da Indexação na modalidade Avaliação Intrínseca Quantitativa ou Intrabibliotecário. O universo de pesquisa constituiu-se de três Bibliotecas universitárias públicas da Universidade de São Paulo: Biblioteca da Faculdade de Odontologia, Biblioteca da Faculdade de Saúde Pública e Biblioteca do Instituto de Psicologia, sendo pesquisados 5 sujeitos (2 catalogadores, 2 indexadores e 1 catalogador-indexador). Os resultados da investigação a partir da coleta de dados e análise dos mesmos apontaram baixos índices de intraconsistência entre os processos de catalogação de assunto e de indexação nas Bibliotecas pesquisadas, porém, dentro da média apontada na literatura. Como considerações finais, verifica-se que a inconsistência é uma característica inerente tanto dos processos de catalogação de assunto como de indexação nos sistemas de recuperação da informação.